Диагностический центр представляет собой современную лабораторию, основной задачей которой является лабораторная диагностика инфекционных заболеваний. В его составе функционируют бактериологическая лаборатория, клинико-диагностическая лаборатория и отделение, специализирующееся на ПЦР-методах. Центр активно участвует в системе внешней оценки качества (ФСВОК), гарантируя высокие стандарты работы и проводя постоянный внутренний контроль. Ежегодно в лабораториях внедряются новые методики, что позволяет расширять спектр диагностируемых инфекций. Специалисты центра активно занимаются научной деятельностью, повышая свою квалификацию и обучая начинающих специалистов. Также на базе центра студенты биологического факультета Челябинского медицинского университета проходят преддипломную практику, а лаборанты участвуют в курсах повышения квалификации для медицинских работников.